控制价问题

有一工程，原招标清单里 有一项 “填淤 ”项目 ，且也给定了16000m3“工程量”，但在项目特征里又明确注明“ 该工程量 为“预估量”，投标人应考虑其风险，投标人根据自身经验核算此量，本工程计量 将此量包死”。查看控制价，此项的控制价是按这个16000m3组价的。所以投标时，投标单位也按16000m3的工程量报了价。在后期实际施工中，发现此工程量严重太低，实际大约45000m3，从而总价上就有300多万元差额。甲方理由是投标之前没有对控制价提出疑义，没有对清单提出疑义，故就视为认可招标控制价，认可清单的，包死量，不予追加。想请教专家，招标控制价在这项上的组价肯定是失去了“客观、公正的原则”，公布的控制价也是过低的。针对此项事情，施工单位有什么解决办法吗？有哪个条款能推翻此条严重错误的清单控制价呢？从而给施工单位予以追加呢？