工程量清单形式如何审核工程进度款？

有一个厂房建设，关于审核进度款有如下几个问题向各位老师请教 1、投标报价是以工程量清单的形式，合同规定的合同价款采用固定单价合同，即采用综合单价的方式确定。那么施工单位报工程进度款的时候是不是也应该用工程量清单的形式，如果施工单位用定额套价是不是不正确，出入很大？ 2、业主方审核的时候是不是也是以投标文件参照。审核工程量*投标文件中的综合单价 但是措施费、规范、税金怎么算呢？ 3、我在投标文件中发现有的工作不同的厂房综合单价不同，比如现浇基础模板，两个厂房的综合单价不一样，这种属于正确的嘛？ 我对清单不是很熟悉，但是项目现在又比较急，所以请各位多多指教 谢谢